Три внутренние двери Троицкого собора - с западной, северной и южной сторон привлекают внимание своей древностью и богатством иконографического содержания их украшений. Все они сделаны в 1595 г. на средства Дмитрия Ивановича Годунова. Двери сделаны из железа и обиты медью. Их лицевые стороны разделены на несколько отдельных рам, в которых размещены сделанные сусальным золотом изображения.
     На западных дверях в двух верхних рамах представлено Благовещение: в одной раме - благовествующий Архангел, в другой - Богоматерь. Ниже - с одной стороны пророк Исайя, которому принадлежит пророческое изречение о зачатии Спасителя от Девы, с другой - пророк Езекииль, изрекший порочество о затворенных вратах. (относящиеся сюда пояснительные надписи гласят: се, Дева во чреве приимет, и родит Сына, и нарекут имя Ему Еммануил). Еще ниже, в следующей раме с одной стороны - лествица Иакова и Богоматерь с надписью: "виде Иаков, и се лествица утверждена на земли, глава же ея досязаше до небеси, и Ангели Божии восхождаху и нисхождаху по ней, Господь же утверждашеся на ней"; с другой стороны - купина Моисея с надписью: "пасе Млисей стадо тестя своего Рагуила, и прииде до горы Хоривски и виде купину, огнем горящую, и его воззва Господь из купины, глаголаше:…Моисей, Моисей, изуй ногу от сапог твоих, место бо есть свято, на нем же ты стоиши, земля свята есть". Еще ниже - философ Ермий с подписью: "Бога убо разумети неудобно, сказати же невозможно, есть бо Трисоставен и не сказанен существом и естество, не имущее в человецех уподобления". В последних двух нижних рамах: Омирос с подписью: "Светило земнее возсияет в языцех, Христос ходити начнет странно и совокупит земная с небесными"; Менандр с подписью: "Неизследовано, и неизреченно, и неразрушительно Божество в Три Лица составляемо, от человек вземлемо и прославляемо".
     Все эти три изображения имеют между собой внутреннюю связь и выражают мысль о явлении Божества во плоти: к этой мысли приводит как изображение Благовещения, так и изображения лиц Ветхого Завета с их прообразованиями, и языческих философов с их предсказаниями о Христе.